A tempada 2012-2013 da Heineken Cup é a 18ª edición da máxima competición continental do rugby europeo. O número de equipos participantes é de 24, igual que nas tempadas anteriores, divididos en 6 grupos de 4, para afrontar a primeira rolda da competición. Tralas 6 xornadas correspondentes a esta primeira rolda, comezarán os cuartos de final e semifinais, a un encontro, e a final. A primeira xornada disputouse nos días 12, 13 e 14 de outubro de 2012, e a gran final terá lugar o 18 de maio de 2013, no Aviva Stadium de Dublín.
Este ano Francia ten 7 representantes no torneo xa que o ano anterior foi campión da European Challenge Cup un equipo deste país, o Biarritz Olympique. Pola súa banda, Irlanda ten 4 representantes, xa que o ano pasado o campión deste torneo foi o Leinster Rugby. O resto dos países teñen o número de representantes previsto na organización da European Rugby Cup.
A fase de grupos comezou o 12 de outubro de 2012 e rematará o 20 de xaneiro de 2013. Os 24 equipos dividíronse en 6 grupos de 4. Cada equipo ten que disputar 6 encontros, 3 como local e outros 3 como visitante. Dos 24 equipos só 8 poderán pasar á fase de cuartos de final. Estes 8 equipos serán os 6 campións de grupo e os restantes 2 equipos con máis puntuación.
O desenvolvemento da fase de grupos vai do seguinte xeito: