Firmicutes

Firmicutes
(ou Bacillota)

Bacillus subtilis con tinguidura de Gram

Dominio:	Bacteria
Filo:	Firmicutes

Clases

As Firmicutes (do latín: firmus cutis, "pel forte", referido aquí a "parede celular forte") son un filo de bacterias, a maioría das cales teñen unha estrutura da parede celular grampositiva. Porén, unhas poucas, como Megasphaera, Pectinatus, Selenomonas e Zymophilus, teñen unha pseudomembrana externa porosa que fai que presenten unha tinguidura gramnegativa.

En anteriores clasificacións recibiron o nome de Firmacutes, que despois se cambiou a Firmicutes cunha diminución na súa composición. Os científicos antes clasificaban en Firmicutes todas as bacterias grampositivas, pero recentemente defínenas como o grupo central de formas relacionadas chamado o grupo de baixo contido G+C, en contraste coas Actinobacteria. Pódense incluír aquí as Molicutes (micoplasmas, sen parede), que noutras clasificacións se clasifican como Tenericutes. Considérase sinónimo de Firmicutes a denominación Bacillota Gibbons et Murray 2021,^[1] que foi proposta como nome oficial en 2021, aínda que isto causou controversia, xa que diversos autores prefiren seguir usando o nome Firmicutes pola súa tradición na literatura.^[2]

As Firmicutes teñen células arredondadas (chamadas cocos) ou bacilares. Moitas Firmicutes producen endósporas, que son resistentes ao desecamento e poden sobrevivir en condicións estremas. Atópanse en diversos ambientes, e o grupo inclúe algúns notables patóxenos. As da familia das heliobacterias, producen enerxía por medio da fotosíntese. Firmicutes son uns dos microorganismos importantes que fan que se pique o viño, a cervexa ou a sidra.

Clases

O grupo divídese tipicamente en Clostridia, que son organismos anaeróbicos, Bacilli, que son aerobios obrigados ou facultativos, e os Mollicutes (micoplasmas, que agora nalgunhas clasificacións se consideran Tenericutes).

Nas árbores filoxenéticas os dous primeiros grupos son parafiléticos ou polifiléticos, como o son os seus principais xéneros, Clostridium e Bacillus.^[3]

Filoxenia

Véxase tamén: Taxonomía bacteriana.

No cladograma móstrase a taxonomía actualmente aceptada do grupo baseada na LPSN (List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature) ^[4] e o NCBI (National Center for Biotechnology Information) ^[5] e a filoxenia está baseada en datos do ARNr 16S da LTP 106 do Proxecto The All-Species Living Tree.^[6]

?Thermodesulfobiaceae

?Synergistaceae {Clostridiales Familia XV Incertae Sedis}

?Thermoanaerobacterales Clado sen nome I [incl. Fervidicola]

?Thermoanaerobacteraceae

?Caldicellulosiruptor

?Thermoanaerobacterales Clado sen nome II

?Halanaerobiales

?Thermaerobacter

?Clostridium thermoamylolyticum ♠ Katkocin et al. 1985

?Thermovorax subterraneus ♠ Makinen et al. 2009

Firmicutes s. s.

	Moorella

	Syntrophomonadaceae

Gelria glutamica

	Symbiobacterium thermophilum

	Sulfobacillus

	Carboxydocella {Clostridiales Familia XVI. Incertae Sedis}

	Thermolithobacter

Clostridia s.s. [incl. Negativicutes]

	Fusobacteriales

	Bacilli [incl. Erysipelotrichia & Mollicutes]

Notas:
♠ Cepas que se encontran no NCBI pero non na LSPN.

Xéneros principais

Actualmente hai máis de 274 xéneros asignados ao filo Firmicutes. Os xéneros máis importantes son os seguintes:

Bacilli, orde Bacillales

Bacilli, orde Lactobacillales

Clostridia

Erysipelotrichi

Erysipelothrix

Saúde

Son Firmicutes a maior parte das especies da flora bacteriana intestinal humana e do rato.^[7] Os Firmicutes da flora intestinal foron implicados na absorción de enerxía e obesidade.^[8]^[9]^[10]

Detección no laboratorio

Ata agora non hai unha forma simple de definir categoricamente unha bacteria dada como pertencente a Firmicutes, xa que o filo é enormemente diverso en características fenotípicas debido a que ao intenso intercambio de plásmidos entre as súas especies e xéneros, pero a presenza de Firmicutes pode agora detectarse por PCR en tempo real utilizando metodoloxías recentemente descritas.^[11]

Notas

↑ Oren A, Garrity GM (2021). "Valid publication of the names of forty-two phyla of prokaryotes". Int J Syst Evol Microbiol 71 (10): 5056. PMID 34694987. doi:10.1099/ijsem.0.005056.
↑ Robitzki, Dan (4 January 2022). "Newly Renamed Prokaryote Phyla Cause Uproar". The Scientist Magazine (en inglés). Consultado o 23 May 2022.
↑ Wolf M, Müller T, Dandekar T, Pollack JD (2004). "Phylogeny of Firmicutes with special reference to Mycoplasma (Mollicutes) as inferred from phosphoglycerate kinase amino acid sequence data". Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 54 (Pt 3): 871–5. PMID 15143038. doi:10.1099/ijs.0.02868-0.
↑ J.P. Euzéby. "Firmicutes". List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). Arquivado dende o orixinal o 27 de xaneiro de 2013. Consultado o 4 xullo 2012.
↑ Sayers; et al. "Firmicutes". National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database. Consultado o 4 xullo 2012.
↑ All-Species Living Tree Project."16S rRNA-based LTP release 106 (full tree)" (PDF). Silva Comprehensive Ribosomal RNA Database. Arquivado dende o orixinal (PDF) o 07 de maio de 2012. Consultado o 4 xullo 2012.
↑ Ley RE, Peterson, DA, Gordon JI. Ecological and Evolutionary Forces Shaping Microbial Diversity in the Human Intestine. Cell. 2006 Feb 24; 124:837-848.
↑ Ley RE, Turnbaugh PJ, Klein S, Gordon JI. Microbial ecology: human gut microbes associated with obesity. Nature. 2006 Dec 21;444(7122):1022-3. PMID 17183309
↑ Henig, Robin Marantz (2006-08-13). "Fat Factors". New York Times Magazine. Consultado o 2008-09-28.
↑ Ley RE, Bäckhed F, Turnbaugh P, Lozupone CA, Knight RD, Gordon JI (2005). "Obesity alters gut microbial ecology". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 102 (31): 11070–5. PMC 1176910. PMID 16033867. doi:10.1073/pnas.0504978102. Consultado o 4 xullo 2012.
↑ Haakensen M, Dobson CM, Deneer H, Ziola B (2008). "Real-time PCR detection of bacteria belonging to the Firmicutes Phylum". Int. J. Food Microbiol. 125 (3): 236–41. PMID 18501458. doi:10.1016/j.ijfoodmicro.2008.04.002. Consultado o 4 xullo 2012.

Véxase tamén

Outros artigos

Epulopiscium fishelsoni, unha bacteria xigante

Ligazóns externas

Phylum "Firmicutes" - J.P. Euzéby: List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature

[1] Oren A, Garrity GM (2021). "Valid publication of the names of forty-two phyla of prokaryotes". Int J Syst Evol Microbiol 71 (10): 5056. PMID 34694987. doi:10.1099/ijsem.0.005056.

[2] Robitzki, Dan (4 January 2022). "Newly Renamed Prokaryote Phyla Cause Uproar". The Scientist Magazine (en inglés). Consultado o 23 May 2022.

[pmid15143038-3] Wolf M, Müller T, Dandekar T, Pollack JD (2004). "Phylogeny of Firmicutes with special reference to Mycoplasma (Mollicutes) as inferred from phosphoglycerate kinase amino acid sequence data". Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 54 (Pt 3): 871–5. PMID 15143038. doi:10.1099/ijs.0.02868-0.

[4] J.P. Euzéby. "Firmicutes". List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). Arquivado dende o orixinal o 27 de xaneiro de 2013. Consultado o 4 xullo 2012.

[5] Sayers; et al. "Firmicutes". National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database. Consultado o 4 xullo 2012.

[6] All-Species Living Tree Project."16S rRNA-based LTP release 106 (full tree)" (PDF). Silva Comprehensive Ribosomal RNA Database. Arquivado dende o orixinal (PDF) o 07 de maio de 2012. Consultado o 4 xullo 2012.

[Ley,_et_al.-7] Ley RE, Peterson, DA, Gordon JI. Ecological and Evolutionary Forces Shaping Microbial Diversity in the Human Intestine. Cell. 2006 Feb 24; 124:837-848.

[Ley,_et_al.2-8] Ley RE, Turnbaugh PJ, Klein S, Gordon JI. Microbial ecology: human gut microbes associated with obesity. Nature. 2006 Dec 21;444(7122):1022-3. PMID 17183309

[9] Henig, Robin Marantz (2006-08-13). "Fat Factors". New York Times Magazine. Consultado o 2008-09-28.

[10] Ley RE, Bäckhed F, Turnbaugh P, Lozupone CA, Knight RD, Gordon JI (2005). "Obesity alters gut microbial ecology". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 102 (31): 11070–5. PMC 1176910. PMID 16033867. doi:10.1073/pnas.0504978102. Consultado o 4 xullo 2012.

[11] Haakensen M, Dobson CM, Deneer H, Ziola B (2008). "Real-time PCR detection of bacteria belonging to the Firmicutes Phylum". Int. J. Food Microbiol. 125 (3): 236–41. PMID 18501458. doi:10.1016/j.ijfoodmicro.2008.04.002. Consultado o 4 xullo 2012.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]