Rizobiáceas

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Rhizobiaceae
Agrobacterium tumefaciens empezando a infectar a unha célula de cenoria.
Agrobacterium tumefaciens empezando a infectar a unha célula de cenoria.
Clasificación científica
Dominio: Bacteria
Filo: Proteobacteria
Clase: Alpha Proteobacteria
Orde: Rhizobiales
Familia: Rhizobiaceae
Conn 1938
Xéneros[2]

Agrobacterium
Carbophilus
Chelatobacter
Kaistia
Rhizobium
Ensifer/Sinorhizobium (sinónimos[1])
Candidatus Liberibacter

As Rizobiáceas (Rhizobiaceae) son unha familia de proteobacterias, nas que se inclúen moitas (pero non todas) especies de rizobios, xunto con parasitos de plantas como Agrobacterium. As Rhizobiaceae son gramnegativas, aerobias e xeralmente con forma de bacilo.[3] Moitas especies de Rhizobiaceae son diazótrofas, xa que poden fixar o nitróxeno e son simbióticas das raíces de plantas, onde forman nódulos radiculares.

Filoxenia[editar | editar a fonte]

A taxonomía actualmente aceptada está baseada na LPSN (List of Prokaryotic Names with Standing in Nomenclature) [2] e no NCBI (National Center for Biotechnology Information)[4] e a filoxenia foi elaborada con datos de ARNr 16S da LTP 106 do The All-Species Living Tree Project.[5]






















Rhizobium lusitanum Valverde et al. 2006



Rhizobium rhizogenes (Riker et al. 1930) Young et al. 2001[6]



Agrobacterium rubi Hildebrand 1940





Rhizobium multihospitium Han et al. 2008



Rhizobium tropici Martínez-Romero et al. 1991




Rhizobium miluonense Gu et al. 2008





Rhizobium leguminosarum (Frank 1879) Frank 1889 (Listas aprobadas en 1980) emend. Ramírez-Bahena et al. 2008[7]






Rhizobium endophyticum López-López et al. 2011



Rhizobium tibeticum Hou et al. 2009




Rhizobium etli Segovia et al. 1993





Rhizobium pisi Ramírez-Bahena et al. 2008




Rhizobium phaseoli Dangeard 1926 (Listas aprobadas en 1980) emend. Ramírez-Bahena et al. 2008



Rhizobium fabae Tian et al. 2008




Rhizobium hainanense Chen et al. 1997





Arthrobacter viscosus Gasdorf et al. 1965[8]



Rhizobium alamii Berge et al. 2009



Rhizobium mesosinicum Lin et al. 2009





Rhizobium sullae Squartini et al. 2002




Rhizobium indigoferae Wei et al. 2002




Rhizobium gallicum Amarger et al. 1997



Rhizobium yanglingense Tan et al. 2001




Rhizobium mongolense Van Berkum et al. 1998



Rhizobium oryzae Peng et al. 2008




Rhizobium loessense Wei et al. 2003




Rhizobium tubonense Zhang et al. 2011







Rhizobium cellulosilyticum García-Fraile et al. 2007



Rhizobium soli Yoon et al. 2010





Neorhizobium galegae Lindström 1989



Neorhizobium vignae Ren et al. 2011





Neorhizobium huautlense Wang et al. 1998



Neorhizobium alkalisoli Lu et al. 2009












Aureimonas altamirensis (Jurado et al. 2006) Rathsack et al. 2011[7][9][10]



Aureimonas frigidaquae (Kim et al. 2008) Rathsack et al. 2011[9][10]




Aureimonas ureilytica (Weon et al. 2007) Rathsack et al. 2011[9][10]




Aurantimonas coralicida Denner et al. 2003 emend. Rathsack et al. 2011.[7][9]




Fulvimarina pelagi Cho e Giovannoni 2003 emend. Rathsack et al. 2011[7][9]




Martelella mediterranea Rivas et al. 2005[7][9]




Allorhizobium undicola (de Lajudie et al. 1998) Young et al. 2001[6]




Allorhizobium vitis (Ophel e Kerr 1990) Young et al. 2001[6]





Allorhizobium borbori Zhang et al. 2011







Beijerinckia fluminensis Döbereiner e Ruschel 1958[11]



Agrobacterium larrymoorei Bouzar e Jones 2001




Agrobacterium radiobacter Beijerinck e van Delden 1902[12]





Rhizobium selenitireducens corrig. Hunter et al. 2008



Rhizobium rosettiformans Kaur et al. 2011






Rhizobium daejeonense Quan et al. 2005






Rhizobium aggregatum (Hirsch e Müller 1986) Kaur et al. 2011



Pararhizobium capsulatum Hirsch e Müller 1986[13]




Pararhizobium giardinii Amarger et al. 1997











Ensifer mexicanus Lloret et al. 2011



Ensifer terangae (De Lajudie et al. 1994) Young 2003[14]




Ensifer saheli (De Lajudie et al. 1994) Young 2003[14]




Ensifer kostiensis (Nick et al. 1999) Young 2003[14]




Ensifer kummerowiae (Wei et al. 2002) Young 2003[14]




Ensifer fredii (Scholla e Elkan 1984) Young 2003[14]



Sinorhizobium americanum corrig. Toledo et al. 2004





Ensifer arboris (Nick et al. 1999) Young 2003[14]



Ensifer garamanticus Merabet et al. 2010




Ensifer meliloti (Dangeard 1926) Young 2003[14]



Ensifer numidicus Merabet et al. 2010





Ensifer adhaerens Casida 1982[7]




Notas[editar | editar a fonte]

  1. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology (2002), 52, 2337 DOI: 10.1099/ijs.0.02524-0. International Committee on Systematics of Prokaryotes Subcommittee on the taxonomy of Agrobacterium and Rhizobium. Minutes of the meeting, 4 July 2001, Hamilton, Canada [1][Ligazón morta]
  2. 2,0 2,1 J.P. Euzéby. "Proteobacteria (scroll down for Rhizobiaceae)". List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). Arquivado dende o orixinal o 27 de xaneiro de 2013. Consultado o 2012-05-02. 
  3. Garrity, George M.; Brenner, Don J.; Krieg, Noel R.; Staley, James T. (eds.) (2005). Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, Volume Two: The Proteobacteria, Part C: The Alpha-, Beta-, Delta-, and Epsilonproteobacteria. New York, New York: Springer. ISBN 978-0-387-24145-6.
  4. Sayers; et al. "Rhizobiaceae". National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database. Consultado o 2012-05-02. 
  5. All-Species Living Tree Project."16S rRNA-based LTP release 106 (full tree)" (PDF). Silva Comprehensive Ribosomal RNA Database. Consultado o 2012-05-02. 
  6. 6,0 6,1 6,2 These species were formerly classified in the genus Agrobacterium.
  7. 7,0 7,1 7,2 7,3 7,4 7,5 Esta é a especie tipo para o xénero.
  8. Arthrobacter viscosus actualmente está clasificada nos Micrococcaceae. Ver Arthrobacter.
  9. 9,0 9,1 9,2 9,3 9,4 9,5 As especies atopadas nos xéneros Aurantimonas, Aureimonas, Fulvimarina, e Martelella están clasificadas actualmente nas Aurantimonadaceae.
  10. 10,0 10,1 10,2 As especies do xénero Aureimonas anteriormente estaban clasificadas no xénero Aurantimonas.
  11. Beijerinckia fluminensis actualmente está clasificada en Beijerinckiaceae.
  12. Estas inclúen Agrobacterium tumefaciens (Smith e Townsend 1907) Conn 1942.
  13. Blastobacter capsulatus actualmente está clasificada nas Bradyrhizobiaceae.
  14. 14,0 14,1 14,2 14,3 14,4 14,5 14,6 Estas especies estaban clasificadas anteriormente no xénero Sinorhizobium.