Saltar ao contido

Base J

Na Galipedia, a Wikipedia en galego.
Base J
Identificadores
Número CAS 53910-89-7
ChemSpider 32742278
Imaxes 3D Jmol Image 1
Propiedades
Fórmula molecular C11H16N2O8
Masa molar 304,25 g mol−1
Se non se indica outra cousa, os datos están tomados en condicións estándar de 25 °C e 100 kPa.

A base J ou β-D-glicopiranosiloximetiluracilo é unha base nitroxenada hipermodificada que se encontra no ADN de protozoos cinetoplástidos, incluíndo o patóxeno humano tripanosoma e nalgúns flaxelados. Foi descuberta en 1993 en Trypanosoma brucei e foi a primeira nucleobase hipermodificada que se encontrou no ADN eucariótico; desde entón atopouse noutros cinetoplástidos, como Leishmania e nalgúns flaxelados.[1][2] Neses organismos a base J actúa como terminador da transcrición para a ARN polimerase II, a súa eliminación en células knockout vai acompañada dunha masiva lectura previa (read-through) dos sitios de terminación da ARN polimerase II, o que finalmente é letal para a célula.[3][4]

A base J sintetízase por medio dunha hidroxilación inicial da timidina, seguida da glicosilación por unha glicosiltransferase que aínda non foi identificada[1]

Biosíntese da base J. A: timidina hidroxilase; B: beta-glicosiltranferase; 1: dT (desoxitimidina); 2: HOCH3dU; 3: dJ
  1. 1,0 1,1 Borst, Piet; Sabatini, Robert (October 2008). "Base J: Discovery, Biosynthesis, and Possible Functions". Annual Review of Microbiology 62 (1): 235–251. PMID 18729733. doi:10.1146/annurev.micro.62.081307.162750. 
  2. Simpson L (1998). "A base called J". Proc Natl Acad Sci USA 95 (5): 2037–2038. Bibcode:1998PNAS...95.2037S. PMC 33841. PMID 9482833. doi:10.1073/pnas.95.5.2037. 
  3. van Luenen, Henri G.A.M.; Farris, Carol; Jan, Sabrina; Genest, Paul-Andre; Tripathi, Pankaj; Velds, Arno; Kerkhoven, Ron M.; Nieuwland, Marja; Haydock, Andrew; Ramasamy, Gowthaman; Vainio, Saara; Heidebrecht, Tatjana; Perrakis, Anastassis; Pagie, Ludo; van Steensel, Bas; Myler, Peter J.; Borst, Piet (August 2012). "Glucosylated Hydroxymethyluracil, DNA Base J, Prevents Transcriptional Readthrough in Leishmania". Cell 150 (5): 909–921. PMC 3684241. PMID 22939620. doi:10.1016/j.cell.2012.07.030. 
  4. Hazelbaker, Dane Z.; Buratowski, Stephen (November 2012). "Transcription: Base J Blocks the Way". Current Biology 22 (22): R960–R962. PMC 3648658. PMID 23174300. doi:10.1016/j.cub.2012.10.010.