A Universidade Autónoma de Querétaro é unha institución de ensino superior no Estado de Querétaro, México. Fundouse o 24 de febreiro de 1951 a raíz do peche da antiga Escola Civil, adquiriu a autonomía o 5 de febreiro de 1959. A súa misión é: Para participar positivamente no desenvolvemento do Estado Querétaro e do país a través de transmitir a educación nas súas distintas formas e tipos de intermediario superior e avanzado.
En 1625 o douro Barrientos, Diego Rivera e a súa esposa Dona Maria Lomelin fixeron unha xenerosa doazón para beneficiar a Compañía de Xesús, a fin de fundar unha escola xesuíta en Querétaro. O padre Pedro Cabrera foi o primeiro director da nova escola, e procedeu á adquisición de inmobles para que se establece o Colexio de Santo Ignacio de Loyola o 20 de agosto de 1625. A orde traballou como tal ata 1767, cando foron expulsados de Querétaro os membros da Compañía de Xesús.
Logo da caída do Imperio de Maximiliano de Habsburgo en maio de 1867, o presidente Benito Juárez Julio M. Cervantes, nomeado gobernador de Querétaro, encomendou ao avogado Prospero C. Veiga a reapertura da antiga escolas xesuíta. Finalmente, o 15 de xaneiro de 1869, a antiga escola de San Francisco e Santo Inácio fúndense nunha única institución co nome do Colexio de Estado Civil.
O 1 de outubro de 1949 tomou posesión do cargo de Gobernador do Estado o coronel e Dr. Octavio S. Mondragón, que promoveu a creación da Universidade de Querétaro. O 24 de febreiro de 1951 abriu a Universidade de Querétaro, e o licenciado Fernando Díaz Ramírez foi o primeiro reitor desta.
A Universidade Autónoma de Querétaro ofrece unha ampla gama de facultades e cada facultade ten varias ramas. Atopamos as seguintes facultades: filosofía, artes plásticas, ciencias da computación, ciencias naturais, enxeñaría, ciencias políticas e sociais, linguas e literatura, contabilidade e administración, medicina, dereito, psicoloxía, enfermería e química.
