Negativicutes

Na Galipedia, a Wikipedia en galego.
Negativicutes
Clasificación científica
Reino: Bacteria
Filo: Firmicutes
Clase: Negativicutes Marchandin et al. 2010
Orde: Selenomonadales Marchandin et al. 2010
Familias e Xéneros

As Negativicutes son unha clase de bacterias Firmicutes, que teñen unha composición peculiar da súa parede celular que se tingue como Gram negativa, a pesar de que a maioria das Firmicutes son Gram positivas. As familias Acidaminococcaceae e Veillonellaceae[1] eran antes consideradas membros da clase Clostridia. O nome Selenobacterias tamén se usa para referirse a algúns membros deste grupo. A descrición deste grupo foi emendada en 2010 e, xunto coas Acidaminococcaceae (familia nova), foi situada na orde Selenomonadales (ordo novus, que sería a única orde do grupo) na clase Negativicutes (classis novus) do filo Firmicutes.

Os membros desta familia son todos anaerobios obrigados, e aparecen en hábitats como ríos, lagos, e os intestinos de vertebrados. Poden ser desde esféricas, como Megasphaera e Veillonella, a bacilos curvados, como as selenomónadas. O xénero Selenomonas ten unha forma característica de crecente, con flaxelos inseridos no seu lado cóncavo, mentres que Sporomusa é similar pero non motil. Os seus nomes refírense a esta morfoloxía distintiva, xa que selene significa lúa, e musa significa banana.[2] Algúns membros do grupo poden formar endosporas.

A clasificación do grupo é complicada, porque un exame máis detallado de membros deste grupo indica que os membros deste clado (grupo Selenomonas-Megasphaera-Sporomusa) son en realidade Clostridia, o que poñería en cuestión o establecemento de Negativicutes coa súa definición actual.[3]

Filoxenia[editar | editar a fonte]

A taxonomía aceptada actualmente deste grupo está baseada na LPSN [4] e no NCBI[5] e foi elaborada baseándose en datos do ARNr de 16S da LTP 111 do The All-Species Living Tree Project [6]


Acidaminococcaceae

Succinispira mobilis Janssen e O'Farrell 1999




Acidaminococcus Rogosa 1969 emend. Jumas-Bilak et al. 2007




Phascolarctobacterium faecium Del Dot et al. 1994 (type sp.)



Phascolarctobacterium succinatutens Watanabe et al. 2012



Succiniclasticum ruminis van Gylswyk 1995





Veillonellaceae

?Anaerospora hongkongensisWoo et al. 2005



?Desulfosporomusa polytropaSass et al. 2004



?Psychrosinus fermentansSattley et al. 2008



?Quinella ovalisKrumholz et al. 1993 (Quin’s Oval)



?Sporotalea colonicaEzaki et al. 2008



Sporomusa Möller et al. 1985






Sporolituus thermophilus Ogg e Patel 2009



Thermosinus carboxydivorans Sokolova et al. 2004





Veillonella Prévot 1933 emend. Mays et al. 1982




Megasphaera [incl. Anaeroglobus geminatus]




Negativicoccus succinicivorans Marchandin et al. 2010



Dialister [incl. Allisonella histaminiformans]








Anaeromusa acidaminophila Baena et al. 1999



Anaeroarcus burkinensis (Ouattara et al. 1992) Strömpl et al. 1999






Acetonema longum Kane e Breznak 1992



Pelosinus Shelobolina et al. 2007





Propionispora Biebl et al. 2001




Dendrosporobacter quercicolus (Stankewich et al. 1971) Strömpl et al. 2000




Anaerosinus glycerini (Schauder e Schink 1996) Strömpl et al. 1999





Propionispira arboris Schink et al. 1983



Zymophilus Schleifer et al. 1990






Megamonas Shah e Collins 1983



Pectinatus Lee et al. 1978 emend. Juvonen e Suihko 2006





Anaerovibrio lipolyticus Hungate 1966



Selenomonas [incl. Schwartzia succinivorans, Centipeda periodontii & Mitsuokella]












Notas:
♠ Cepas que se encontran no NCBI, pero que non están listadas na LPSN
♪ Procariotas dos que non hai cultivos axénicos ou puros illados ou dispoñibles.

Notas[editar | editar a fonte]

  1. Morotomi M, Nagai F, Sakon H (July 2007). "Genus Megamonas should be placed in the lineage of Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; 'Acidaminococcaceae'; Megamonas". Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 57 (Pt 7): 1673–4. DOI:10.1099/ijs.0.65150-0. PMID 17625216. http://ijs.sgmjournals.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=17625216. 
  2. Marchandin, H.; Teyssier, C.; Campos, J.; Jean-Pierre, H.; Roger, F.; Gay, B.; Carlier, J. -P.; Jumas-Bilak, E. (2009). "Negativicoccus succinicivorans gen. Nov., sp. Nov., isolated from human clinical samples, emended description of the family Veillonellaceae and description of Negativicutes classis nov., Selenomonadales ord. Nov. And Acidaminococcaceae fam. Nov. In the bacterial phylum Firmicutes". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 60 (6): 1271–1279. doi:10.1099/ijs.0.013102-0. PMID 19667386.
  3. Yutin N, Galperin MY (2013) A genomic update on Clostridial phylogeny: Gram-negative spore formers and other misplaced Clostridia. Environ Microbiol doi: 10.1111/1462-2920.12173. PMID 23834245. [1]
  4. J.P. Euzéby. "Negativicutes". List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) [2]. http://www.bacterio.cict.fr/classifphyla.html#Firmicutes. Consultado o 2013-03-20. 
  5. Sayers et al.. "Negativicutes". National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database [3]. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Undef&id=909932&lvl=6&lin. Consultado o 2013-03-20. 
  6. All-Species Living Tree Project."16S rRNA-based LTP release 111 (full tree)". Silva Comprehensive Ribosomal RNA Database [4]. http://www.arb-silva.de/fileadmin/silva_databases/living_tree/LTP_release_111/LTPs111_SSU_tree.pdf. Consultado o 2013-03-20.