Acuíficas
| Acuíficas | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Clasificación científica | |||||||||
|
|||||||||
| Familias | |||||||||
|
|||||||||
As acuíficas ou Aquificae son un filo de bacterias, que comprende un conxunto diverso de bacterias que viven en ambientes con condicións extremas. [1][2] Atopáronse en fontes termais, pozas sulfurosas, e chemineas hidrotermais oceánicas. Membros do xénero Aquifex, por exemplo, prosperan en augas que están entre 85 e 95 °C. Son os membros dominantes na maioría das fontes termais terrestres neutras ou alcalinas por riba dos 60 graos Celsius. Son autótrofas, e son os principais fixadores de carbono nos ambientes onde viven.
Taxonomía [editar]
Actualmente non hai un consenso sobre a taxonomía dos xéneros incluídos en Aquificae. Un texto estándar inclúe só os xéneros Aquifex, Calderobacterium, Hydrogenobacter, e Thermocrinis na orde Aquificales. [3] Outras fontes consideran que, ademais dos xéneros incluídos nas familias Aquificaceae e Hydrogenothermaceae, hai outros xéneros que son incertae sedis (non clasificados), pero están situados dentro de Aquificae; ditos xéneros son: Balnearium, Desulfurobacterium, EX-H1 group, e Thermovibrio.
Cavalier-Smith postulou que Aquificae forma parte das Proteobacteria. [4]
Xunto coas Thermotogae, varias especies de Aquificae son eubacterias termófilas, e algúns estudos moleculares consideran que son grupo próximos. [2]
Filoxenia [editar]
- Véxase tamén: Taxonomía bacteriana.
O cladograma representa a taxonomía actualmente aceptada do grupo baseada na LPSN (List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature) [5] e nos datos do NCBI (National Center for Biotechnology Information) [6] e a filoxenia está baseada en datos das secuencias dos ARNr de 16 S do LTP 106 do Proxecto The All-Species Living Tree Project. [7] [8]
Nota:
♠ Cepas atopadas no NCBI pero non na LPSN.
Notas [editar]
- ↑ Griffiths E, Gupta RS (January 2006). "Molecular signatures in protein sequences that are characteristics of the phylum Aquificae". Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 56 (Pt 1): 99–107. DOI:10.1099/ijs.0.63927-0. PMID 16403873. http://ijs.sgmjournals.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=16403873.
- ↑ 2,0 2,1 Horiike T, Miyata D, Hamada K, et al. (January 2009). "Phylogenetic construction of 17 bacterial phyla by new method and carefully selected orthologs". Gene 429 (1–2): 59–64. DOI:10.1016/j.gene.2008.10.006. PMC 2648810. PMID 19000750. http://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0378-1119(08)00524-6.
- ↑ Griffiths E, Gupta RS (March 2004). "Signature sequences in diverse proteins provide evidence for the late divergence of the Order Aquificales". Int. Microbiol. 7 (1): 41–52. PMID 15179606. http://www.im.microbios.org/25march04/07%20Griffiths.pdf.
- ↑ Catalogue of Organisms: Standing the Heat
- ↑ J.P. Euzéby. "Aquificae". List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) [1]. http://www.bacterio.cict.fr/classifphyla.html#Aquificae. Consultado o 5 xullo 2012.
- ↑ Sayers et al.. "Aquificae". National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database [2]. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Undef&id=200783&lvl=6&lin. Consultado o 5 xullo 2012.
- ↑ All-Species Living Tree Project."16S rRNA-based LTP release 106 (full tree)". Silva Comprehensive Ribosomal RNA Database [3]. http://www.arb-silva.de/fileadmin/silva_databases/living_tree/LTP_release_106/LTPs106_SSU_tree.pdf. Consultado o 5 xullo 2012.
- ↑ "Bergey's Taxonomic Outlines: Volume 4 - Draft Taxonomic Outline of the Bacteroidetes, Planctomycetes, Chlamydiae, Spirochaetes, Fibrobacteres, Fusobacteria, Acidobacteria, Verrucomicrobia, Dictyoglomi, and Gemmatimonadetes". Bergey's Manual Trust: 15. 2008. http://bergeys.org/outlines/Bergeys_Vol_4_Outline.pdf.