Alfaproteobacterias
| Alfaproteobacterias | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Micrografía electrónica dunha célula de insecto con bacterias Wolbachia no seu interior. de Public Library of Science / Scott O'Neill |
|||||||
| Clasificación científica | |||||||
|
|||||||
| Ordes | |||||||
|
|||||||
As alfaproteobacterias [1] ou Alphaproteobacteria (ás veces escrito alfa-proteobacterias ou proteobacterias alfa[1]) son un tipo de bacterias Gram-negativas que forman unha clase do filo Proteobacteria.[2]
Índice |
Características [editar]
As Alphaproteobacteria comprenden maioritariamente xéneros fotótrofos, pero tamén varios xéneros que metabolizan compostos dun só carbono (por exemplo, Methylobacterium spp.), simbiontes de plantas (por exemplos, Rhizobium spp.) e animais, e un grupo de patóxenos, as Rickettsiaceae. Ademais, os precursores das mitocondrias das células eucarióticas pénsase que se orixinaron a partir de Rickettsia spp. (ver teoría endosimbiótica). Debido ás súas propiedades simbióticas, os investigadores usan frecuentemente as Alphaproteobacteria do xénero Agrobacterium nas técnicas de transferencia de xenes alleos a xenomas de plantas, e teñen tamén moitas outras aplicacións biotecnolóxicas. [3] As bacterias fotótrofas anoxixénicas aeróbicas son alfaproteobacterias, e son unha parte do plancto mariño de ampla distribución, que poden chegar a supoñer o 10% de toda a comunidade microbiana de alta mar.
Evolución e xenómica [editar]
A clase Alphaproteobacteria comprende dez ordes, que son: Magnetococcales, Rhodobacterales, Rhodospirillales, Rickettsiales, Sphingomonadales, Caulobacterales, Kiloniellales, Kordiimonadales, Parvularculales e Sneathiellales. [4][5] Nas árbores filoxenéticas baseadas en secuencias concatenadas de grandes conxuntos de datos de proteínas, as especies destes ordes das que xa se secuenciou o xenoma ramifícanse na seguinte orde, desde a rama máis antiga á máis recente: Magnetococcales-Rickettsiales-Rhodospirillales-Sphingomonadales-Rhodobacterales-(Caulobacterales-Parvularculales)- Rhizobiales.,[6][7] [8] As análises comparativas dos xenomas secuenciados levaron á descuberta de moitas mutacións por insercións e delecións (indeis) conservados en proteínas amplamente distribuídas e nas proteínas completas (é dicir, proteínas "sinatura"), que son características distintivas ou ben de todas as Alphaproteobacteria, ou ben das súas ordes principais (Rhizobiales, Rhodobacterales, Rhodospirillales, Rickettsiales, Sphingomonadales e Caulobacterales) e familias (Rickettsiaceae, Anaplasmataceae, Rhodospirillaceae, Acetobacteraceae, Bradyrhiozobiaceae, Brucellaceae e Bartonellaceae). Estas sinaturas moleculares proporcionan novos métodos para clasificar estes grupos taxonómicos e para a identificación e asignación de novas especies a cada un dos grupos. [9][6] Análises filoxenéticas e indeis conservados en gran cantidade doutras proteínas fornecen evidencias de que as Alphaproteobacteria se ramificaron antes ca moitos outros filos e clases de bacterias, agás as Betaproteobacteria e Gammaproteobacteria. [10][11]
Filoxenia [editar]
- Véxase tamén: Taxonomía bacteriana.
A filoxenia aceptada actualmente deste grupo está baseada na LPSN (List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature) [5] e na base de datos taxonómicos do NCBI (National Center for Biotechnology Information) [12] e a filoxenia está baseada nos datos do ARNr de 16 S da LTP 106 do Proxecto The All-Species Living Tree [13]
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Notas:
♠ Cepas que se atopan no NCBI, pero non na LPSN.
Notas [editar]
- ↑ 1,0 1,1 O nome científico en latín do taxon é Alphaproteobacteria, polo que se pasa ao galego como alfaproteobacterias. Non está en inglés, porque se o estivese estaría xustificado dicir proteobacterias alfa.
- ↑ "www.ncbi.nlm.nih.gov". http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Info&id=28211. Consultado o 29 xuño 2012.
- ↑ Heribert Hirt - Lab times 2008 - Intruder Alert
- ↑ Don J. Brenner; Noel R. Krieg; James T. Staley; George Garrity (2005). The Proteobacteria: Part A Introductory Essays. シュプリンガー・ジャパン株式会社. pp. 172–. ISBN 978-0-387-24143-2. http://books.google.com/books?id=yviRIumE5HgC&pg=PA172. Consultado o 29 xuño 2012.
- ↑ 5,0 5,1 J.P. Euzéby. "Alphaproteobacteria". List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) [1]. http://www.bacterio.cict.fr/classifphyla.html#Proteobacteria. Consultado o 29 xuño 2012.
- ↑ 6,0 6,1 Gupta, R.S. and Mok, A. (2007) Phylogenomics and signature proteins for the alpha Proteobacteria and its main groups. BMC Microbiol. 2007 Nov 28;7(1):106; PMID 18045498
- ↑ Williams KP, Sobral BW, Dickerman AW: A robust species tree for the Alphaproteobacteria. J Bacteriol. 2007 Jul;189(13):4578-86. PMID 17483224
- ↑ Bazylinski DA, Williams TJ, Lefèvre CT, Berg RJ, Zhang CL, Bowser SS, Dean AJ, Beveridge TJ. (2012) Magnetococcus marinus gen. nov., sp. nov., a marine, magnetotactic bacterium that represents a novel lineage (Magnetococcaceae fam. nov.; Magnetococcales ord. nov.) at the base of the Alphaproteobacteria. Int J Syst Evol Microbiol. DOI 10.1099/ijs.0.038927-0
- ↑ Gupta RS: Protein signatures distinctive of Alphaproteobacteria and its subgroups and a model for Alpha proteobacterial evolution. Crit Rev Microbiol 2005, 31: 135. PMID 15986834
- ↑ Gupta, R.S. (2000) Phylogeny of Proteobacteria: Relationships to other eubacterial phyla and to eukaryotes. FEMS Microbiol. Rev. 24: 367-402.
- ↑ Gupta, R.S. and Sneath, P.H.A. (2007) Application of the Character compatibility approach to generalized molecular sequence data: Branching order of the Proteobacterial subdivisions. J. Mol. Evol. 64: 90-100.
- ↑ Sayers et al.. "Alphaproteobacteria". National Center for Biotechnology Information (NCBI) [2]. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Tree&id=28211&lvl=3&lin. Consultado o 2011-06-05.
- ↑ 'The All-Species Living Tree' Project."16S rRNA-based LTP release 106 (full tree)". Silva Comprehensive Ribosomal RNA Database [3]. http://www.arb-silva.de/fileadmin/silva_databases/living_tree/LTP_release_106/LTPs106_SSU_tree.pdf. Consultado o 29 xuño 2012.
Véxase tamén [editar]
Outros artigos [editar]
Ligazósn externas [editar]
- MeshName - Alphaproteobacteria [4]
- Filoxenis bacteriana (procariotas): Alpha Proteobacteria.
