Acuíficas

Na Galipedia, a Wikipedia en galego.
Acuíficas
Clasificación científica
Dominio: Bacteria
Filo: Aquificae
Clase: Aquificae Reysenbach 2002
Orde: Aquificales Reysenbach 2002
Familias

As acuíficas ou Aquificae son un filo de bacterias, que comprende un conxunto diverso de bacterias que viven en ambientes con condicións extremas.[1][2] Atopáronse en fontes termais, pozas sulfurosas, e chemineas hidrotermais oceánicas. Membros do xénero Aquifex, por exemplo, prosperan en augas que están entre 85 e 95 °C. Son os membros dominantes na maioría das fontes termais terrestres neutras ou alcalinas por riba dos 60 graos Celsius. Son autótrofas, e son os principais fixadores de carbono nos ambientes onde viven.

Taxonomía[editar | editar a fonte]

Non hai un consenso sobre a taxonomía dos xéneros incluídos en Aquificae. Un texto estándar inclúe só os xéneros Aquifex, Calderobacterium, Hydrogenobacter, e Thermocrinis na orde Aquificales.[3] Outras fontes consideran que, ademais dos xéneros incluídos nas familias Aquificaceae e Hydrogenothermaceae, hai outros xéneros que son incertae sedis (non clasificados), pero están situados dentro de Aquificae; ditos xéneros son: Balnearium, Desulfurobacterium, EX-H1 group, e Thermovibrio.

Cavalier-Smith postulou que Aquificae forma parte das Proteobacteria.[4]

Xunto coas Thermotogae, varias especies de Aquificae son eubacterias termófilas, e algúns estudos moleculares consideran que son grupo próximos.[2]

Filoxenia[editar | editar a fonte]

Véxase tamén: Taxonomía bacteriana.

O cladograma representa a taxonomía aceptada do grupo baseada na LPSN (List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature) [5] e nos datos do NCBI (National Center for Biotechnology Information) [6] e a filoxenia está baseada en datos das secuencias dos ARNr 16S do LTP 106 do Proxecto The All-Species Living Tree Project.[7] [8]

Thermosulfidibacter takaii Nunoura et al. 2008

  Desulfurobacteriaceae

?Phorcysium thermohydrogeniphilumVetriani 2011

?Desulfurobacterium crinifexAlain et al. 2003

Desulfurobacterium thermolithotrophum L'Haridon et al. 1998

Desulfurobacterium atlanticum L'Haridon et al. 2006

Desulfurobacterium pacificum L'Haridon et al. 2006

Thermovibrio ruber Huber et al. 2002

Balnearium lithotrophicum Takai et al. 2003

Thermovibrio ammonificans Vetriani et al. 2004

Thermovibrio guaymasensis L'Haridon et al. 2006

  Hydrogenothermaceae
  Persephonella

P. guaymasensis Götz et al. 2002

P. hydrogeniphila Nakagawa et al. 2003

P. marina Götz et al. 2002

Venenivibrio stagnispumantis Hetzer et al. 2008

Hydrogenothermus marinus Stöhr et al. 2001

  Sulfurihydrogenibium

S. yellowstonense Nakagawa et al. 2005

S. azorense Aguiar et al. 2004 emend. Nakagawa et al. 2005

S. subterraneum Takai et al. 2003 emend. Nakagawa et al. 2005

S. kristjanssonii Flores et al. 2008

S. rodmanii O'Neill et al. 2008

  Aquificaceae

Hydrogenobaculum acidophilum (Shima e Suzuki 1993) Stöhr et al. 2001

Thermocrinis minervae Huber et al. 1999

  Hydrogenobacter

H. hydrogenophilus (Kryukov et al. 1984) Stöhr et al. 2001

H. thermophilus Kawasumi et al. 1984

Hydrogenobacter subterraneus Takai et al. 2001

?Thermothrix azorensis Odintsova EV et al. (1996)

Thermocrinis ruber Huber et al. 1999

Thermocrinis albus Eder e Huber 2002

  Aquifex

A. aeolicusHuber e Stetter 2001

A. pyrophilus Huber e Stetter 1992

  Hydrogenivirga

H. calditorris Nakagawa et al. 2004

H. okinawensis Nunoura et al. 2008

Nota:
♠ Cepas atopadas no NCBI pero non na LPSN.

Notas[editar | editar a fonte]

  1. Griffiths E, Gupta RS (2006). "Molecular signatures in protein sequences that are characteristics of the phylum Aquificae". Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 56 (Pt 1): 99–107. PMID 16403873. doi:10.1099/ijs.0.63927-0. Arquivado dende o orixinal o 27 de xaneiro de 2018. Consultado o 05 de xullo de 2012. 
  2. 2,0 2,1 Horiike T, Miyata D, Hamada K; et al. (2009). "Phylogenetic construction of 17 bacterial phyla by new method and carefully selected orthologs". Gene 429 (1–2): 59–64. PMC 2648810. PMID 19000750. doi:10.1016/j.gene.2008.10.006. 
  3. Griffiths E, Gupta RS (2004). "Signature sequences in diverse proteins provide evidence for the late divergence of the Order Aquificales" (PDF). Int. Microbiol. 7 (1): 41–52. PMID 15179606. Arquivado dende o orixinal (PDF) o 14 de abril de 2012. Consultado o 05 de xullo de 2012. 
  4. Catalogue of Organisms: Standing the Heat
  5. J.P. Euzéby. "Aquificae". List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). Arquivado dende o orixinal o 13 de xuño de 2011. Consultado o 5 xullo 2012. 
  6. Sayers; et al. "Aquificae". National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database. Consultado o 5 xullo 2012. 
  7. All-Species Living Tree Project."16S rRNA-based LTP release 106 (full tree)" (PDF). Silva Comprehensive Ribosomal RNA Database. Arquivado dende o orixinal (PDF) o 07 de maio de 2012. Consultado o 5 xullo 2012. 
  8. Ludwig, W., Euzéby, J., & Whitman W.B. (2008). "Bergey's Taxonomic Outlines: Volume 4 - Draft Taxonomic Outline of the Bacteroidetes, Planctomycetes, Chlamydiae, Spirochaetes, Fibrobacteres, Fusobacteria, Acidobacteria, Verrucomicrobia, Dictyoglomi, and Gemmatimonadetes" (PDF). Bergey's Manual Trust: 15. Arquivado dende o orixinal (PDF) o 08 de novembro de 2016. Consultado o 05 de xullo de 2012.